A vegetação presente as margens do rio protege principalmente contra assoreamento. O desmatamento ou seja a destruição da vegetação as margens do Rio Marataoan é uma ameaça, além de ser um crime ambiental.
Desta feita o Velho Marataoan está ameaçado por causa da destruição da vegetação natural que fica nas suas margens. Imagens feitas durante a ação irresponsável do poder público que tem à frente Edílson Capote mostram máquinas cometendo tal crime ambiental a luz do dia. Chegou o governo da destruição.
